一、優勢原料藥
加快實現具有我國自主知識產權及國內首次開發藥物的產業化。
重點發展臨床需要且具有獨特療效的急救藥物、心血管藥物、糖尿病藥物、抗腫瘤藥物、抗病毒及提高機體免疫功能藥物。
采用酶法生產7-氨基頭孢烷酸、發酵法生產7-氨基-3-去乙酰氧基頭孢烷酸、"一步發酵法"生產維生素C等新工藝，改造提升現有抗生素及維生素等傳統出口優勢品種。
推進基因工程技術、細胞工程技術、發酵工程技術、酶工程技術及現代制藥工業的分離、提取、結晶和手性合成技術等高新技術在
醫藥產品生產中的應用，進一步優化工藝、提高產品質量和技術經濟指標。
實現麻黃素等天然藥物的人工合成技術及其產業化。
推進浙東南化學原料藥出口基地的建設以及石家莊、沈陽、淄博、哈爾濱等老醫藥工業基地的技術改造。
二、生物技術領域
加快實現具有我國自主知識產權的生物工程藥物產業化。
加快生物工程技術在維生素、抗生素、氨基酸等方面的應用。
加快計劃免疫產品的GMP（藥品生產質量管理規范）改造，如百白破疫苗、乙腦疫苗、麻疹疫苗等。
發展具有較好市場前景的新型疫苗，如適用于全人群的流感病毒疫苗、多價肺炎球菌多糖疫苗、輪狀病毒疫苗、痢疾疫苗、腫瘤疫苗、愛滋病疫苗等。
加快發展診斷用生物芯片。
三、中藥現代化
支持中藥材的規范化與標準化種植。
加快實現中藥提取物及中藥飲片濃縮顆粒的產業化。
推廣指紋圖譜等多成分定量指標控制技術在中藥生產中的應用。
推進現代先進技術在中藥生產中的應用，如超臨界二氧化碳提取、動態提取、大孔樹脂吸附、膜技術、噴霧干燥、冷凍干燥、超微粉碎等技術。
推進先進制劑技術與輔料在中藥生產中的應用。
發展高效、速效、長效和劑量小、毒性小、副作用小及使用方便的新型中藥。
加快名優產品的技術創新與技術改造。
四、新型制劑
發展市場前景較好的新產品和名牌產品;
我國不能生產、需要進口的產品;
緩釋、控釋、速釋制劑、靶向制劑、定量吸入劑，鼻腔給藥制劑、膜劑等新劑型;
優質、新型制劑輔料，如新型粘合劑、崩解劑、包衣材料、助溶劑、表面活性劑等;
微囊技術、包合物技術、滲透泵技術、脂質體技術等先進技術在制劑中的應用;
能滿足品種多樣化、規格系列化、操作密閉化、機電一體化、符合GMP要求的制藥裝備，如超微粉碎設備、動態提取設備、新型生物反應器等。