整個系統由三層網絡構成：管理系統、中央監控系統、現場設備控制站。管理系統、中央監控系統通過以太網相連，中央監控系統、現場設備控制站通過工業以太網進行數據交換。
管理系統由應用服務器、生產管理及辦公計算機、調度及信息發布控制計算機、網絡交換機、打印機、網絡接入設備等組成。
中央監控系統由兩臺互為熱備的監控計算機、投影儀系統、三臺中央服務器、工程師站計算機、打印機、通訊前置機、工業網絡交換機組成。
根據工藝特點和構筑物的平面布置，共設5個現場控制站：
預處理控制站（PLC1）
二級處理控制站（PLC2）
加氯加藥控制站（PLC3）
泥沙處理控制站（PLC4）
加壓泵房控制站（PLC5）
五個控制站的控制系統全部采用南大傲拓自主研發的NA-400系列PLC和NA-VIEW觸摸屏，所有PLC和HMI均支持工業以太網，通過工業交換機接入廠級光纖環網，與I/O服務器、報警/歷史數據服務器、工程師站計算機通訊。工業以太網的優點在于通訊距離遠、傳輸速度快、抗干擾能力強。
現場的各種水泵、閥門、儀表等通過I/O模塊采集、控制，I/O模塊分為開關量輸入/輸出模塊、模擬量采集模塊（電流/電壓/熱電偶/熱電阻）、模擬量輸出模塊（電流/電壓）、高速計數模塊（脈沖采集）。有些帶串口通訊的設備像電磁流量計、變頻器等，也可以通過CMM串口通訊模塊讀寫數據（流速/累計流量、變頻器頻率設定/反饋等）。
本工程自動控制系統安全、實用、經濟、高效，能達到當前水廠自動化先進水平。水廠自動監測控制系統遵從“集中管理、分散控制、數據共享”的原則，系統各部分有相對獨立性；并可利用網絡技術完成系統的縱向與橫向擴展；檢修系統的任一部分，不會影響其它部分的正常運行。
